营养器官和生殖器官之间的相互关系也是表现为既相互依赖，又相互制约。营养生长是生殖生长的基础，根、茎、叶等器官只有健壮地生长，才能为花、果实、种子的形成和发育创造良好的条件。而果实和种子的良好发育则又为新一代的营养器官的生长奠定了物质基础。营养器官与生殖器官的相互制约亦表现在对营养物质的争夺上。如果营养物质过多地消耗在营养器官的生长上，营养生长过旺，就会推迟生殖生长或使生殖器官发育不良。从而导致禾谷类作物的贪青晚熟和棉花、果树的落花落果。但如果营养物质过多地消耗在生殖器官的生长上，生殖生长过旺，反之也会影响营养器官生长势和生长量的下降，甚至导致植株的过早衰老和死亡。

合理调整两者的关系，使营养器官的生长和生殖器官的生长协调地、有目的地发展，在生产上具有重要的意义。如供应充足水肥，摘除花或花芽，或适当修剪，可以使以营养器官为收获对象的植物（如茶、桑、麻及叶菜类的蔬菜）获得丰产；如棉花生产上可以通过整枝打顶、去除赘芽等措施，控制营养器官的生长，而保证棉铃、棉桃的生长等。果树生产上巧妙地利用两者的关系，可以消除“大小年”现象，获得年年丰产。